Pozoruhodný rekord: 13 200 editací v jediné buňce!

Je to k neuvěření. Mezinárodní výzkumný tým dokázal editovat jedinou lidskou buňku 13 200 krát a dotyčná buňka to přežila. Proslulý genetik George M. Church z Harvardu a jeho kolegové mají být na co pyšní.

Editor CRISPR už dal patřičně najevo, co je zač, a notně rozbouřil média po celém světě. Molekulární biologové a genetici přitom stále zkoušejí nové a nové způsoby, jak tento zázračný dar bakterií využít. Mimo jiní zkoušejí i to, kolik editací snese jedna buňka. Až do teď byl rekord 62 editací, k nimž došlo kvůli úsilí odstranit z genomu prasete pozůstatky retrovirů.

Church a spol. se rozhodli zapracovat na technologii mnohonásobné editace jediné buňky, protože chtějí odstranit z buňky všechny LINE-1 transpozony. To jsou parazitické DNA sekvence, které většinou v genomu spí, ale mohou se i aktivovat. Podle dřívějších výzkumů jsou v genomu zbytečné a mohou dokonce škodit.

Právě transpozony LINE-1, které jsou typicky asi 6 tisíc párů bází dlouhé, přitom tvoří asi 17 procent lidského genomu. To znamená, že v jedné buňce je LINE-1 elementů hodně. Vědci by rádi zjistili, jak by buňka fungovala bez nich. Kdyby je ale chtěli vyeditovat jeden po druhém, tak to bude nesmírně zdlouhavé a nákladné. Proto se teď Church a spol. snaží vyeditovat všechny LINE-1 v jediné buňce najednou.

Badatelé nejprve zkusili běžný editor CRISPR, ten ale obvykle při mnohonásobné editaci buňku poškodí nebo zničí. Proto posléze použili upravenou verzi, takzvaný CRISPR base editor, který nerozstříhává celou dvoušroubovici DNA, ale mění jednotlivá písmena v řetězci. Navzdory ohromujícímu výkonu a novému rekordu se vědcům po 13 200 editacích povedlo vymazat zatím jenom asi polovinu LINE-1 elementů v lidské buňce. Teď bude hledat cesty, jak zdolat ten zbytek.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: