Vědci přečetli komplikovaný genom burského oříšku

Mezinárodní úsilí týmu, který vedli odborníci americké agentury Agricultural Research Service (ARS), vedlo k úspěšnému detailnímu přečtení komplexního genomu pěstované podzemnice olejné, čili burského oříšku. V tomto genomu bychom mohli nalézt řešení pro zlepšení odolnosti vůči škůdcům či odolnosti vůči suchu.

Vědci se pustili do tohoto projektu, aby pronikli do molekulárních a buněčných mechanismů, které zodpovídají za růst a vývoj rostlin podzemnice, stejně jako za utváření zásadních znaků podzemnice, typu množství produkovaných semen, kvality oleje v semenech nebo odolnost vůči nemocem a parazitům, jako jsou například háďátka.

Podzemnice olejná Arachis hypogaea je významná plodina, která poskytuje velmi výživná semena, a také olej. Semena kromě oleje obsahují bílkoviny, vitamíny a další užitečné látky. V dnešní době se podzemnice ve světě pěstuje asi na 24 milionech hektarů. Ve Spojených státech se podzemnice pěstuje od Virginie až po Floridu, a západním směrem až po Nové Mexiko. Každoročně se v USA sklidí burské oříšky za asi 2 miliardy dolarů.

Napínavá historie burských oříšků se začala odvíjet před několika tisíci let v jižní Americe, kde se ve vzácné evoluční události příznivě smísily genomy dvou planě rostoucích předků podzemnice olejné – Arachis duranensis a Arachis ipaensis. Výsledkem této události je dnešní podzemnice s komplikovaným genomem, který je téměř tak velký, jako lidský genom. Obsahuje zhruba 3 miliardy párů bází.

Tým ARS a jejich spolupracovníků použil pokročilé technologie pro čtení DNA. S jejich pomocí jako první detailně přečetli celý genom burského oříšku, v tomto případě komerčně pěstované odrůdy podzemnice olejné „Tifrunner“. Tím doplnili dosavadní snahy o čtení genomu podzemnice, které spočívaly v analýze původních genomů předků podzemnice olejné.

Autor: RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D.

Líbil se Vám tento článek? Doporučte jej svým známým.

Více informací najdete zde: